昆明医科大学海源学院创建于2001年，是由始建于1933年的昆明医科大学申办并获教育部批准的独立学院。

学院现有杨林、高新两个校区，杨林校区为主校区。2021年录取的新生在杨林校区报到。杨林校区坐落于规划现代的国家级产业新区滇中空港经济区云南省嵩明职业教育基地，主要承担前期基础课程教学。高新校区坐落于昆明市国家高新技术产业开发区内，主要承担后期见习、实践课程教学，是昆明市政府授予的“昆明市园林式单位”。

为积极响应国家号召，扩大高等教育资源供给，促进高等教育发展，2001年5月，经教育部批准，遵义医科大学牵头创办全日制本科独立学院遵义医学院科技学院。2001年9月，学院正式招生。

二十一年来，学院依托遵义医科大学的师资队伍、教育教学质量体系及各类教学科研平台，充分发挥资源优势，坚持立德树人的根本目标，坚持教学中心地位，大力实施本科教学质量工程，为学生创造了良好的学习环境和实习实践条件。学院人才培养以社会需求为导向，以优良的教育教学质量为根本，致力于为基层培养厚基础、强技能、重人文、高素质，具有自主学习能力、创新思维和社会责任感的应用型人才。