招收理工类考生，学制：四年；学生合格毕业授予工学学士学位。
培养目标：培养适应社会主义现代化建设和社会经济发展需要的德智体美劳全面发展，掌握制药工程学科基础知识、基本理论和基本技能，具备创新精神、创业意识和实践能力，能够从事制药工程领域科学研究、技术开发、工程设计以及药品生产、流通、管理、质量控制和药学服务等方面工作的应用型、高素质的本科制药工程专门人才。
主要课程：有机化学、物理化学、化工原理、生物化学、药物化学、工业药剂学、药物分析、制药工艺学、制药设备与车间设计、制药过程安全与环保、药品生产质量管理工程等。
就业方向：医药院校、科研机构、药品生产企业、药品经营企业、药品检验机构、药品监督管理部门等，或继续攻读研究生。
★专业特色：制药工程专业具有明确的专业方向和突出的办学特色，即培养学生具有药学学科基础理论、基本知识和基本实验技能，以及与其相关的中药学等方面的知识和技能，并结合云南种类繁多的中药和天然药物资源，定位于“突出区域天然药物资源的优势，重点发展天然药物深加工及其改性方向，强化建设制药工程学科理工特色”，做到专业覆盖面广，学习化学、化工、药物化学、药厂工艺设计及设备等方面的基础理论、实验操作技能以及企业车间设计能力，同时本专业以大面积的公共课程为平台，大类课程和专业课程以及实践性教学环节为中心，工程特色突出，知识的应变能力强。