(一) 专业简介
北京工商大学生物工程专业办学历史悠久，其前身是原北京轻工业学院于1958年创建的、国内早的发酵工程专业，1983年更名为生物化工专业，1998年调整名称为生物工程专业。本专业在2003年获得生物化工硕士学位授予权，2016年获得发酵工程硕士学位授予权，是北京工商大学重点建设学科。
本专业以“厚基础、宽口径、重实践”为指导思想，培养既具有系统的生物学理论基础，又掌握现代应用生物技术基本技能，能在生物医药、食品、能源化工、检验检疫、农产品加工、环保等领域从事科学研究、产品研发、教学及技术管理的综合性工程技术人才。
(二) 专业特色
生物工程技术是当代高新科技的主要领域之一。本专业结合在轻工行业的传统优势，注重生物技术在食品、生物医药、化工和资源环境等领域的综合应用。主要利用基因工程、细胞工程、发酵工程等现代生物技术开发安全、高效的生物源食品添加剂及功效因子，开展传统发酵的工艺技术优化和食品贮藏保鲜技术研究，研究高效分离纯化技术及其在高活性、高附加值天然生物活性成分制备中的应用，研究生物制品的质量控制和安全性评价的方法。
(三) 学术科研成果
先后承担“973”、“863”、国家科技支撑计划项目、国家自然科学基金、北京市自然科学基金等50余项。近5年，承担国家重点研发计划及国家科技支撑计划课题3项，国家自然科学基金项目10项。研究成果获北京市科技进步一等奖，以及多项省部级科技发明奖。
(四) 师资力量
本专业现有教授3人，副教授12人，讲师9人，实验师2人。其中具有博士学位23人，具有博士后研究经历8人，国外研究经历7人。包括北京市科技新星2人，北京市高校中青年骨干教师1人，北京高校优秀共产党员1人。获北京市科学技术一等奖3人、三等奖1人、教育部科学技术一等奖1人，行业科技进步奖5人。多位教师担任国家自然科学基金、科技部和相关行业协会评审专家以及国内外学术团体的技术顾问。
(五) 主要专业课程
无机化学、有机化学、物理化学、化工原理、生物化学、微生物学、普通生物学、细胞生物学、基因工程、发酵工程、酶工程、细胞工程、生物分离工程、生物工程设备等。
(六) 实践教学
本专业拥有约1000平米专业实验室，配备微生物鉴定仪、超速冷冻离心机、显微镜、厌氧控制培养系统、色谱仪、进口发酵装置等现代化生物仪器设备，本科开设生物化学、微生物、生物分离工程、基因工程等实验课程，为学生提供丰富的实践教学条件。与很多国内大型企业具有友好的合作关系，在北京二商集团、燕京啤酒集团、王致和有限公司、北京电子科技职业学院等企业和培训机构建有校外教学实践基地，供本系学生参观实习及进行生产操作实训，使理论与实践相结合，培养技能型人才。