医药学院始建于1952年，前身为中国人民解放军第四军医大学吉林军医学院，共为军队和地方培养了3万余名医务人才，被誉为“白衣战士的摇篮”。2004年8月，经国务院、中央军委批准，学校由军队整体移交吉林省，成为省属公办高等学校，是吉林省惟一独立设置的西医本科院校。2013年顺利通过教育部本科教学工作合格评估。

学校坐落在美丽的“北国江城”—吉林市，学校是国家绿化模范单位、吉林省园林式单位。校区位于吉林市吉林大街5号，校本部占地面积52.60万平方米，建筑面积27.42万平方米，固定资产8.60亿元，教学、科研仪器设备总值7315.51万元。馆藏纸质图书80万册，中外文数据库23个；文体活动中心建筑面积0.50万平方米；体育运动场占地面积5.16万平方米；校园主干网为千兆带宽。

五年制高职招生计划属指令性计划，带招生指标。毕业后颁发国家承认的大专文凭，并有报到证（与派遣证类似），可以参加国家机关和事业单位的录用考试。