培养目标：生物工程专业是国家级特色专业和江苏省重点专业类专业。本专业培养生物技术与工程领域一线工程师基本训练的应用型高级专门人才。学生毕业后应具有创新创业精神和社会责任感，掌握生物学、化学、工程学基本知识，具备生物工程及其产业化的科学原理、工艺技术过程和工程设计等基础理论和工程实践能力，面向轻工、医药、食品、环保、现代农业、疾病预防控制和卫生检测工作、商检等企事业单位，从事与生物技术和工程相关的生产、管理、品质分析与控制、设计、新技术研究、新产品开发等工作。

主要课程：工程化学、生物化学、微生物学、化工原理、生物工艺学、生物反应工程、生物分离工程、生化设备与工厂设计、基因工程、酶工程、细胞工程、仪器分析、生物安全、酿造工艺学、代谢过程控制、生物质能工程等。