学院设有药学院、医护系、管理学系、智能工程系、信息工程系、建筑工程系、基础教学部和继续教育学院8个二级教学单位，共开设43个专业。其中中药学、连锁经营管理、中药制药技术、药品质量与安全为中央财政支持建设专业；中医学、针灸推拿为国控专业；中药学、中药制药技术、药学、药品质量与安全、药品经营与管理、连锁经营管理、机电一体化技术、医疗设备应用技术等专业为省级特色专业；电气自动化技术、电子商务、市场营销、护理为省级综合改革试点专业；服务外包、高速铁路客运乘务、网络营销、财务管理、汽车智能技术为地方新兴专业。

       就业方面，我院郑重承诺：入校学生学习成绩全部合格者保证就业，否则退还学费，入校时可签订就业合同。我院还系国家劳动和社会保障部推广的SYB项目试点院校，对暂未理想就业和有志创业的毕业生免费提供SYB项目培训，帮助其实现自己的创业理想。我院实行订单式教育，已在上海、东莞、南京、合肥、连云港、苏州、杭州、深圳、北京等地建立就业基地，构建了较为完善的就业网络。近几年我院毕业生就业率均在98%以上，就业经验在全省交流。

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    亳州职业技术学院坐落在国家级历史文化名城和被誉中华第一药都的安徽省亳州市。老子、庄子、曹操、华佗等贤人先哲皆生于此，厚重源远的文化底蕴，先进创新的教育理念，推进着亳州职业技术学院的快速发展。
    亳州职业技术学院地处亳州市药都大道，毗邻行政中心，交通便捷，周围环境优美。