创建于19、20世纪之交的圣约翰大学医学院、震旦大学医学院和同德医学院三座古老的医学殿堂，于1952年合并成立了上海第二医学院，1985年改名上海第二医科大学。2005年7月，两所有着百余年办学历史的大学——上海交通大学和上海第二医科大学合并，成立了新上海交通大学和上海交通大学医学院。

医学院坚持发扬“海纳百川、博采众长”的优良传统，大力弘扬“博极医源、精勤不倦”的医学院精神，逐渐形成了富有自身特点的办学风格和特色。两校合并之后，医学院人在“除人类之病痛、助健康之完美”的孜孜追求中，又融入了上海交大“饮水思源、爱国荣校”的责任与梦想。

学生升学·就业·游学介绍

几年来学院总体就业率一直保持较高水平，向社会输送了众多的高素质医学专门人才。2011年学院毕业生的就业率达99.03%，其中七年制255人，就业率100%，本科468人，就业率98.50%，总体就业率99.03%。其中本科、长学制毕业生签约三级医院的有402人，占毕业生人数的55.6%；签约二级医院的有28人，占毕业生人数的3.9%；基地升学的有63人，占毕业生人数的8.7%；普通升学的有153人，占毕业生人数的21.2%；其他（包括出国、就业非医疗单位、公务员）的有77人，占毕业生人数的10、6%。

继续推动医学院国际化办学水平，短期游学项目已遍及北美、欧洲、澳洲、亚洲和港台，共13个国家和地区， 43项交流项目，涉及32所知名医学院校。2011年度海外游学交流学生（通过学院选拔的）共196人（未包括法文班最后一年去法国FFE项目19人）；本科生参加交流的比例达到32.9%。

学院按本科毕业生的比例，每年批准一批优秀学生免试直升研究生。去年免试直升研究生的比例已达43.8％；同时，未能直升研究生者也可通过参加全国统一的研究生入学考试，取得深造的机会。