学院前身是国立黄河流域水利工程专科学校，始建于1929年，历经黄河水利专科学校、黄河水利学院、黄河水利学校等历史沿革，1998年3月经原国家教委批准，改制为黄河水利职业技术学院。

学院原隶属国家水利部，现实行中央与河南共建，属全额预算拨款的公办高等院校。1999年被教育部、财政部列入“面向21世纪教育振兴行动计划”支持建设院校，2005年教育部等七部委授予我院为全国职业教育先进单位。2006年荣膺河南省最具特色的十佳职业院校，被教育部、财政部确定为首批国家示范性高等职业院校立项建设单位，并得到教育部、财政部、河南省等巨额专项资金的支持，2009年通过国家级验收成为国家示范性高等职业院校。