生物工程专业是2001年在原有的化学工程与工艺、生物化工、环境科学等专业基础上筹建，于2003年开始招生。现有微生物理学硕士点和生物化工工学硕士点。近两年承担科研项目20余项，其中国家自然科学基金3项，铁道部重点课题1项，甘肃省生物技术专项2项，甘肃省自然科学基金项目3项。获得省部级科技进步二等奖2项，省部级科技进步三等奖2项，发明专利3项。现有专业教师21人，其中博士生导师2人、硕士生导师12人。具有博士硕士学位的教师占91%。

毕业生能够在生物工程相关产业（生物化工、生物制品、生物制药、发酵工程、细胞工程、酶工程、食品工程、环境生物工程、生物检测等）行业从事产品研发、工艺设计、生产管理、营销等工作，也可在高校从事科学研究和教学工作。本专业具有考研优势，年考研率达40%左右。

主干课程：高等数学、线性代数、无机化学与分析化学、有机化学、生物化学、化工原理、生化工程、微生物学、细胞生物学、分子生物学、基因工程、细胞工程、蛋白质工程、微生物工程、发酵工程、生物工程下游技术、生物化学反应工程、生物工程设备及设计、制药工程、酶工程、环境生物工程等。

主要专业方向：发酵工程、食品工程、生物制药

环境工程专业成立于1984年，是甘肃乃至全国开办最早的专业之一。1986年经国务院学位办授权，成为全国第一批拥有环境工程硕士授予权的学科，2003年具备博士授予权。目前该学科是铁道部和甘肃省重点学科，拥有环境工程测试中心铁道部重点实验室、甘肃省交通储运扬尘治理工程技术研究中心、甘肃省环境科学与技术实验教学示范中心等省部级科研平台，在全国，特别是西北地区有一定的影响力。经过将近30年的专业建设和发展，环境工程专业已经形成了一支完整的、高效的教学、科研团队，在课堂教学、培养学生理论联系实际能力等实践教学环节方面工科特色鲜明。近两年承担国家水污染控制重大专项、国家自然科学基金、中国-意大利国际合作等科研项目数10余项，在水污染治理、环境监测、环境规划及环境评价等方面，成绩突出。现有职教师15人，博士生导师1人， 硕士生导师11人，具有博士、硕士学位的教师占95%。

毕业生具备水、气、声、固体废物等污染防治和给排水工程、环境规划和资源保护等方面的知识，具有进行污染控制工程的设计及运营管理能力，制定环境规划和进行环境管理的能力，以及环境工程方面的新理论、新工艺和新设备的研究和开发能力。可从事规划、施工、设计、管理、教育和研究开发方面的工作。

主干课程：物理化学、化工原理、工程力学、流体力学、环境微生物学、水污染控制工程、大气污染控制工程、固体废物处理处置工程、物理性污染控制工程、环境监测、环境评价、地下水污染与治理、环境规划与管理等。