生物医学工程专业起源于1978年设立的重庆大学无线电系生物医电研究室，1986年起在国内较早开展生物医学工程本科生培养，是重庆市“三特”重点建设本科专业、重庆市首批建设“一流专业”。本专业重点学习生物医学、电子信息等基础理论知识，通过学习掌握医疗信息检测、健康数据分析挖掘及智能医疗知识和实践能力，面向大健康产业培养医工交叉融合的复合型创新人才。
通过本专业的学习，将具备生物医学、电子信息技术、医疗健康数据分析的专业知识，具有将电子信息技术用于解决医疗健康复杂工程问题的知识运用和医工融合实践创新能力。通过本专业的学习，学生将具备医疗电子电路分析、医学信息检测软件设计等实践技能，具有医疗仪器与健康装备系统设计、医疗健康数据分析的科学研究和工程实践能力，可从事医工交叉融合的健康工程及相关领域的项目策划、组织实施、技术应用推广等工程技术或组织管理工作。