| 二级教学机构 | 系别 | 专业 |
| 计算机科学与技术学院 | 计算机科学与技术系 | 计算机科学与技术 |
| 软件工程系 | 软件工程、软件工程（卓越计划班） | |
| 网络安全学院 | 网络空间安全系 | 网络工程 |
| 数学与数据科学系 | 信息与计算机学 | |
| 电子工程与智能化学院 | 电子工程系 | 电子信息工程、电子信息工程（卓越班） |
| 通信工程系 | 通信工程 | |
| 电气与自动化系 | 电气工程及其自动化、自动化 | |
| 光电工程系 | 光电信息科学与工程 | |
| 生态环境与建筑工程学院 | 材料科学与工程系 | 高分子材料与工程 |
| 环境科学与工程系 | 环境工程 | |
| 建筑工程系 | 工程管理、土木工程、建筑学 | |
| 化学工程与能源技术学院 | 应用化学系 | 应用化学（化学工程工艺卓越班）、食品质量检测、化学工艺 |
| 化学工程系 | 化学工程与工艺 | |
| 能源与动力工程系 | 能源与动力工程 | |
| 机械工程学院 | 机电与设计工程系 | 机械设计制造及其自动化、机械设计制造及其自动化（卓越班） |
| 工业工程系 | 工业设计、工业工程 | |
| 材料加工工程系 | 材料成型与控制工程 | |
| 文学与传媒学院 | 中文系 | 汉语言文学、文化产业管理 |
| 传媒系 | 学 | |
| 外语系 | 英语（商务英语） | |
| 经济与管理学院 | 管理系 | 人力资源管理、工商管理 |
| 金融系 | 经济与金融 | |
| 国际贸易与创新创业教育系 | 国际经济与贸易（含跨境电商） | |
| 会计系 | 会计学 | |
| 法律与社会工作学院（知识产权学院） | 法律系 | 法学 |
| 公共管理系 | 行政管理 | |
| 社会工作系 | 社会工作 | |
| 教育学院（师范学院） | 教育系 | 汉语言文学（师范）、小学教育（数学） |
| 音乐系 | 音乐学（音乐教育）、音乐学（舞蹈） | |
| 体育系 | 社会体育指导与管理 | |
| 国际学院 | ||
| 东莞理工学院粤台产业科技学院 | 机械设计系 | 机械设计制造及其自动化（精密制造） |
| 自动化系 | 自动化 | |
| 跨境电商系 | 跨境电商 | |
| 经济与金融系 | 经济与金融 | |
| 多媒体设计系 | 计算机科学与技术（多媒体设计） | |
| 工业设计系 | 工业设计 | |
东莞理工学院法国国立工艺学院联合学院 （中外合作办学） | 通信工程、软件工程、机械设计制造及其自动化 |
五年制高职招生计划属指令性计划，带招生指标。毕业后颁发国家承认的大专文凭，并有报到证（与派遣证类似），可以参加国家机关和事业单位的录用考试。
